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百科 网页新闻贴吧知道网盘图片视频地图文库资讯采购百科百度首页登录注册进入词条全站搜索帮助首页秒懂百科特色百科知识专题加入百科百科团队权威合作下载百科APP个人中心ρ播报讨论上传视频物理、数学符号收藏查看我的收藏0有用+10ρ（读作[rəʊ]，大写Ρ，小写ρ，中文音译：柔）是第十七个希腊字母。西里尔字母的 Р 及拉丁字母的 R 都是由 Rho 演变而成。外文名ρ读    音[rəʊ]属    性第十七个希腊字母意    思密度字母学术领域物理，数学LaTeX表示\rho目录1常用意义2希腊字母表常用意义播报编辑小写ρ用于：●1、ρ表示密度符号ρ=m/V（式中m代表物质质量，V代表物质体积）推导式m=ρ×VV=m/ρ与之相关公式：p=ρgh（式中ρ表示液体密度，g表示重力加速度，h表示液体深度）：F浮=G排=m排g=ρ液gV排=ρ液gV物（浸没）（式中ρ液表示液体密度，g表示重力加速度，V排表示物体排开液体体积）。●2、R=ρl/S（式中ρ表示电阻率，l表示导体长度，S表示导体截面积）。●3、ρ也表示曲率半径，公式：法向加速度a=v²/ρ（应用于曲线运动中的圆周运动）。●4、ρ（Rho）还代表一种蛋白质，协助原核生物一类转录的终止。●5、ρ还表示离开原点(在极坐标系中)或极轴(在柱坐标系中)的极径。极径也常常用字母r表示，但为了与球坐标系的极径区分清楚，惯用的记号是球坐标系用r，而极坐标系和柱坐标系用ρ。●6、ρ在角度与弧度的转换中，用来代表一弧度所对应的秒值，一般取206265。7、在素数计算函数里，ρ是黎曼函数的所有非平凡零点。希腊字母表播报编辑大写小写英文读音国际音标意义Ααalpha/'ælfə/角度，系数，角加速度Ββbeta/'beitə/磁通系数，角度，系数Γγgamma/ˈɡæmə/电导系数，角度，比热容比Δδdelta/'deltə/变化量，屈光度，一元二次方程中的判别式Εεepsilon/ep'silon/对数之基数，介电常数Ζζzeta/'zi:tə/系数，方位角，阻抗，相对粘度Ηηeta/'i:tə/迟滞系数，机械效率Θθtheta/'θi:tə/温度，角度Ιι ℩iota/ai'oute/微小，一点Κκkappa/ˈkæpə/介质常数，绝热指数∧λlambda/ˈlæmdə/波长，体积，导热系数Μμmu/mju:/磁导系数，微，动摩擦系（因）数，流体动力粘度Ννnu/nju:/磁阻系数，流体运动粘度,光子频率Ξξxi/ksi/随机数，（小）区间内的一个未知特定值Οοomicron/oumaik'rən/高阶无穷小函数∏πpi/pai/圆周率，π(n)表示不大于n的质数个数Ρρrho/rou/电阻系数，柱坐标和极坐标中的极径，密度∑σ ςsigma/'sigmə/总和，表面密度，跨导，正应力Ττtau/tau/时间常数，切应力Υυupsilon/ju:p'silən/位移Φφphi/fai/磁通，角，透镜焦度，热流量Χχchi/kai/统计学中有卡方(χ2)分布Ψψpsi/psai/角速，介质电通量Ωωomega/'oumigə/欧姆，角速度，交流电的电角度新手上路成长任务编辑入门编辑规则本人编辑我有疑问内容质疑在线客服官方贴吧意见反馈投诉建议举报不良信息未通过词条申诉投诉侵权信息封禁查询与解封©2024 Baidu 使用百度前必读 | 百科协议 | 隐私政策 | 百度百科合作平台 | 京ICP证030173号 京公网安备110000020000

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白_百度百科 网页新闻贴吧知道网盘图片视频地图文库资讯采购百科百度首页登录注册进入词条全站搜索帮助首页秒懂百科特色百科知识专题加入百科百科团队权威合作下载百科APP个人中心收藏查看我的收藏0有用+10Rho蛋白播报讨论上传视频蛋白质种类本词条缺少概述图，补充相关内容使词条更完整，还能快速升级，赶紧来编辑吧！Rho蛋白属于小G蛋白超家族的亚家族成员，已发现了20多个Rho家族成员（图7-1）。根据序列的同源程度和功能，将其分为RhoA、Racl、Cdc42及缺乏GTP酶活性等四大类。中文名Rho蛋白分    组RhoA、Racl、Cdc42及缺乏GTP类    数四大类所属家族小G蛋白超家族目录1简介2物质介绍简介播报编辑Rho belongs to the Ras super family of low molecular weight GTPases. Fifteen Rho proteins have already been characterized and divided into three sub-families; the first includes Rho （A， B， C）， the second， Rnd 1-3 and the third which includes Rac 1-3， RhoG， Cdc42Hs， Rho/TTF. TC10 and Chp. Rho acts as a molecular switch which turns on of off various intracellular signaling pathways such as ACK， PAKs， MEKKs ROCK. Rho is active when bound to GTP and inactive when bound to GDP. It is also known to participate in many physiological activities including cell migration， adhesion， cytokinesis， proliferation， differentiation and apoptosis and to a greater extend cell transformation.Rho属于低分子量GTpase的Ras超家族。已有15个Rho蛋白被鉴定为3个亚家族，第一个包括Rho（A，B，C），第二个是Rnd1-3，第三个是rac1-3，RhoG，Cdc42Hs，Rho/TTF，TC10和Chp。Rho作为一个分子开关，它可以打开或关闭各种细胞内信号通路，如ACK、PAKs、MEKKs ROCK。Rho在与GTP绑定时是活跃的，而在与GDP绑定时是不活跃的。它还参与许多生理活动，包括细胞迁移、粘附、胞质分裂、增殖、分化和凋亡，并在更大程度上参与细胞转化。物质介绍播报编辑Rho家族蛋白是Ras超家族中最早被克隆出来的蛋白，它们是一组相对分子质量大约为20～25kD的三磷酸鸟苷（guanosine triphosphate，GTP）结合蛋白，具有GTP酶活性，因此，习惯被称为Rho GTP酶，Rho GTP酶在细胞骨架重组调控方面起重要作用。近年来研究发现，Rho GTP酶在多种恶性肿瘤中高表达，并和肿瘤的发生、侵袭和转移密切相关。本文主要从肿瘤细胞形态改变，细胞与胞外基质粘附以及细胞骨架重组等几个方面，对Rho GTP酶作用于肿瘤侵袭转移的分子调控机制综述如下。Rho GTP酶Rho GTP酶超家族已发现约20个成员，根据结构和功能不同，大致分为5个亚家族，包括：（1）Rho亚家族，包括RhoA、RhoB和RhoC，在序列上具有高度同源性，并在多种细胞中高表达，主要参与张力纤维形成和粘着斑复合体（focal adhesion complexs，FACs）组装；（2）Rac亚家族：包括Rac1、Rac2、Rac3和RhoG，促进层状伪足和胞膜皱褶形成；（3）Cdc42亚家族，包括Cdc42、TC10、TCL、Wrch1和chp/Wrch2，其中Cdc42促进丝状伪足形成；（4）Rnd亚家族：包括Rnd1、Rnd3/RhoE和Rnd2，在细胞中组成性激活表达并具有不同的组织分布，可拮抗Rho信号通路；（5）Rho BTB亚家族，包括Rho BTB1和Rho BTB2，具体功能尚不清楚。在所有Rho GTP酶超家族成员中，Cdc42、Rac1和RhoA是研究最多的Rho GTP酶。Rho家族各成员在氨基酸序列上有50%～55%的同源性，在靠近催化位点处都有1个能和GTP结合的功能区，与催化GTP水解密切相关。Rho GTP酶同Ras超家族的其他成员一样，羧基端通常具有共同结构域，即由半胱氨酸残基，脂族残基和其他氨基酸残基组成的末端，是翻译后修饰的位点。Rho GTP酶的翻译后修饰与其质膜定位有关，只有经翻译后修饰的Rho GTP酶才具有活性并能与细胞膜上适宜的脂质分子结合。在异戊烯基转移酶的作用下，半胱氨酸的巯基和异戊二烯基团间共价形成硫醚键，并在内切酶的作用下水解掉末端其余3个残基，最后异戊二烯基化的半胱氨酸残基在甲基转移酶的作用下发生甲基化，完成翻译后的修饰。Rho家族蛋白同Ras超家族的所有成员一样在活性型/GTP限制型和失活型/二磷酸鸟苷（guanosine diphosphate，GDP）限制型构象之间循环。调节这个循环过程的3类重要蛋白是：（1）鸟苷酸交换因子（guaninenucleotide exchanging factors，GEFs），催化GDP的释放和GTP的结合，活化Rho GTP酶。不同的Rho GEF在结构上都具有相同的功能域，包含1个DH（Dbl homology domain）区和1个PH（pleckstrin homologyv domain）区，前者与Rho GTP酶结合并催化其构象改变，后者通过和细胞膜上特定的脂质作用使GEF在膜上定位；（2）GTP酶活化蛋白（GTPase activating protein，GAP），作为负向调节因子加速Rho GTP酶的水解，使Rho GTP酶由活性状态变为无活性状态；（3）GDP解离抑制因子（GDP dissociation inhibitor，GDI），阻止GDP从Rho GTP酶上分离，抑制Rho GTP酶活性。Rho GTP酶是细胞内多条信号转导通路的关键分子，作为分子开关在胞内信号转导中发挥桥梁作用。Rho GTP酶可参与对正常细胞增殖、分化、凋亡的调节，并与肿瘤的发生和转移密切相关。实验研究发现，在多种肿瘤中可见Rho GTP酶表达异常，改变细胞内Rho GTP酶的表达水平可以直接影响肿瘤细胞侵袭和转移的过程。Rho GTP酶与肿瘤的侵袭转移肿瘤细胞在基质中的运动由4个循环往复的步骤组成，即头部伪足的形成和延伸，新粘附位点的建立，胞体的收缩以及尾部的退缩，通过不断重复的4个过程向前迁移。对这一过程精确调节的分子机制非常复杂，涉及胞内多条信号转导通路。在多条信号级连反应通路中，Rho GTP酶尤其是RhoA、Rac1和Cdc42是关键的调控因子，主要参与对细胞形态改变，细胞与基质粘附及细胞骨架重组的调控，调节肿瘤细胞的侵袭转移过程。2.1 细胞形态改变伪足形成和细胞形态改变是侵袭转移的起始步骤。Rac可诱导质膜突起形成片状样的层状伪足，而Cdc42诱导指头样突起的丝状伪足形成。在高侵袭和转移性的肿瘤细胞，还可见一种侵袭伪足形成，由于与细胞外基质降解密切相关，可能成为主要的伪足结构。层状伪足与周围基质形成粘附连接，产生细胞向前运动的锚着位点；丝状伪足有助于细胞对周围环境的适应及确定细胞迁移的方向。Wiskott Aldrich综合征蛋白家族（Wiskott Aldrich syndrome protein，WASP）是调节细胞迁移的关键分子，包括神经组织来源WASP（neural Wiskott Aldrich syndrome protein，NWASP），WASP家族富含脯氨酸同源蛋白1（WASP family verprolin homologous protein1，WAVE1），WASP家族富含脯氨酸同源蛋白2（WASP family verprolin homologous protein2，WAVE2）等成员，也是Rac和Cdc42下游的重要效应子，在肿瘤细胞中高表达，Rac和Cdc42通过活化WASP家族成员诱导伪足形成和基质降解。Lorenz等首次使用荧光共振能量传感器区分活性状态和失活状态的NWASP构象，并模拟内源性NWASP功能发现，NWASP在迁移的肿瘤细胞头部层状伪足形成中起重要作用。细胞迁移头部高度动态性伪足结构的形成依赖肌动蛋白单体聚合和肌动蛋白纤维的延长，WASP家族不同成员通过不同的结构域与Rac和Cdc42结合而活化，而肌动蛋白相关2/3复合体（actinrelated 2/3 complexs，Arp2/3 complexs）和肌动蛋白单体通过分别结合于活化的WASP家族羧基端共同的结构域，直接调控肌动蛋白单体聚合。Arp2/3复合体是肌动蛋白组装的核心，可将肌动蛋白单体从头合成组装为肌动蛋白丝，进而促进丝状伪足和层状伪足的形成。Arp2/3复合体与WASP的结合是调控肌动蛋白聚合的重要因素，两者在多种肿瘤细胞中共表达，对115例肺腺癌组织切片免疫组化染色发现，78例（678%）共表达Arp2/3和WAVE2，并与病人临床生存时间负相关；多变量回归分析揭示，Arp2/3和WAVE2的共表达是肿瘤复发的独立危险因素。并且NWASP和Arp2/3复合体也是高侵袭和转移性肿瘤细胞侵袭伪足形成的主要调节子，并可能成为肿瘤治疗的重要靶位。肌动蛋白单体的聚合和伪足形成还依赖另一种关键调节子cofilin，cofilin可使肌动蛋白单体从肌动蛋白丝的顶端解离，诱导肌动蛋白丝从头部折断，产生新的末端。Rac和Cdc42可通过活化共同的底物p21激活激酶（p21 activated kinase，PAK），分别激活LIM（3种同源异型结构域蛋白lin11、isl1和mec3）激酶1（LIM kinase 1，LIMK1）和LIM激酶2（LIM kinase 2，LIMK 2），磷酸化cofilin使其失活而抑制肌动蛋白的解聚，稳定肌动蛋白细胞骨架。2.2 细胞基质粘附伪足形成启动细胞迁移的过程，但细胞持续的迁移需依赖细胞伪足与细胞外基质（extracellular matrix，ECM）的稳定粘附，提供细胞向前迁移的牵引支点。迁移的细胞头部与ECM的粘附和尾部与ECM的去粘附的不断交替使得细胞向前迁移，Rho GTP酶对这一过程发挥精确的调节。细胞表面的整合素受体与ECM中特异的配体结合，通过整合素聚集成簇而形成FACs，而整合素受体的胞内区与桩蛋白（paxillin），纽蛋白（vinculin）和踝蛋白（talin）等多种肌动蛋白结合蛋白相互作用形成分子桥，并与细胞骨架相连，提供细胞迁移的锚着位点。活化的Rac可诱导肌动蛋白的聚合和层状伪足的形成，同时也能诱导新的FACs的形成，而FACs的形成又能反过来活化Rac，这一正反馈的失控可增加肿瘤细胞的侵袭能力。Jung发现，活化的Rac1和Cdc42，可通过激活PAKl磷酸化下游的粘着斑激酶（focal adhesion kinase，FAK），活化的FAK作为分子支架招募胞浆中桩蛋白，纽蛋白和踝蛋白等至FACs，促进FACs的形成。p65激活激酶还可通过LIMK间接调节cofilin的活性，cofilin在活性型和失活型间的循环可调节肌动蛋白亚单位从肌动蛋白丝末端的解离和聚合，并对促进肌动蛋白纤维组装时踏车（treadmilling）现象的发生非常必要。肿瘤细胞侵袭和转移与ECM的降解密切相关，Rho GTP酶可直接或间接调节下游效应子促进ECM的降解。对人乳腺癌细胞株MDAMB435的研究发现，Rac1和Cdc42可通过间接活化LIMKl上调丝氨酸蛋白酶尿激酶型纤溶酶原激活剂（urokinase type plasminogen activator，uPA）系统，增加uPA启动子活性，诱导uPA和uPA受体mRNA和蛋白表达及uPA的分泌，降解ECM胶原等成分，有助于细胞的侵袭转移。2.3细胞骨架重组侵袭和转移的肿瘤细胞的持续运动需依靠张力纤维收缩和肌动蛋白丝的延长提供动力，Rho GTP酶可通过调节细胞骨架的重组，为细胞迁移提供动力。张力纤维是真核细胞中一种稳定的、平行排列的微丝结构，由肌动蛋白、肌球蛋白、原肌球蛋白等组成，肌动肌球蛋白相对运动产生的收缩力是细胞迁移动力的主要来源。Rho及其下游的Rho相关卷曲螺旋形成蛋白激酶（Rho associated coiledcoil forming protein kinase，ROCK）可提升肌球蛋白轻链（myosin light chain，MLC）的磷酸化水平，增加肌动-肌球蛋白的收缩力促使细胞在ECM中的迁移。ROCK是Rho下游的重要效应分子，包括Rho激酶和p160 ROCK 2个成员。活化的ROCK通过2条通路提升MLC的磷酸化水平，一方面ROCK磷酸化其底物肌球蛋白轻链磷酸酶（myosin light chain phosphatase，MLCP）的肌球蛋白结合亚单位（myosin binding subunit，MBS）而抑制MLCP的磷酸酶活性，减少MLC磷酸基团的水解；另一方面，ROCK可直接磷酸化MLC，增加MLC的磷酸化水平，从而增加与肌动蛋白丝交联产生的收缩力。抑制Rho/Rock通路能抑制肿瘤细胞张力纤维的收缩和细胞侵袭，显性激活（dominant active）的p160 ROCK的质粒转染的人卵巢癌细胞具有更强的侵袭和迁移能力，而用p160 ROCK的反义寡核苷酸处理的癌细胞侵袭和迁移能力可显著减弱。Rho还可作用于下游另一重要效应分子mDia（Mammalian Diaphanousrelated protein）蛋白，活化的mDia蛋白可将肌动蛋白单体参入到肌动蛋白丝的末端，并阻止成帽蛋白的结合，诱导肌动蛋白丝的延长，有助于细胞迁移。3、Rho GTP酶在肿瘤侵袭转移诊断和治疗中的意义由于Rho GTP酶在许多恶性肿瘤中高表达，因此，Rho GTP酶可能成为肿瘤转移的临床诊断指标。对53例胃癌病人和7名胃肿瘤细胞株的Rho超家族7名主要成员RhoA、RhoB、RhoC、Rac1、Rac2、Rac3和Cdc42mRNA表达水平的检测发现，RhoA、Rac1和Cdc42在胃癌组织切片中的平均表达水平显著高于癌旁组织切片，RhoA的表达水平与肿瘤分期显著正相关并和组织分化程度负相关，RhoA和Rac1在7种胃肿瘤细胞株中的mRNA表达水平，总蛋白量及活性都显著高于正常胃粘膜上皮细胞株。RhoC在许多恶性肿瘤中高表达，特别是在转移性肿瘤中表达异常增高。在原发胃癌细胞中RhoC的表达显著高于正常胃上皮细胞，在有淋巴结转移的原发胃癌中RhoC的表达显著高于没有淋巴结转移的原发癌，在有多个淋巴结转移的原发胃癌中RhoC的表达也显著高于较少淋巴结转移的胃癌细胞，穿过浆膜的胃癌细胞比在胃壁中的胃癌细胞具有更高的RhoC表达，表明RhoC的过表达与肿瘤细胞的高度浸润相关，提示RhoC可作为胃癌病人临床预后的重要指标。鉴于Rho GTP酶与肿瘤转移的相关性，使其可能成为转移性肿瘤临床转移及预后分析的重要指标。由于Rho GTP酶与肿瘤侵袭转移密切相关，Rho GTP酶及其下游靶分子可能成为抑制肿瘤转移的重要靶位。特异性的ROCK抑制剂Wf536可在体内抑制小鼠Lewis肺癌转移及肿瘤细胞诱导的新生毛细血管生成，并在体外抑制肿瘤细胞在基质胶上的侵袭和迁移。由于Rho GTP酶翻译后羧基端的修饰对于其正确的膜定位和活化非常重要，因此多种异戊烯基转移酶抑制剂如Zarnestra，Sarasar，L778等，通过阻断Rho GTP酶C端翻译后修饰位点的蛋白质法呢基化，已被证实在肿瘤治疗中有较好疗效，而且针对某一种Rho GTP酶（如RhoA、RhoB、Rac1或Cdc42）的特异性异戊烯基转移酶抑制剂将具有更好的临床治疗效果。由于针对Rho GTP酶进行的肿瘤治疗能够减少传统抗癌药物的副作用，因此Rho GTP酶已成为肿瘤药物开发的新靶位，对于肿瘤的临床治疗将具有良好的应用前景。新手上路成长任务编辑入门编辑规则本人编辑我有疑问内容质疑在线客服官方贴吧意见反馈投诉建议举报不良信息未通过词条申诉投诉侵权信息封禁查询与解封©2024 Baidu 使用百度前必读 | 百科协议 | 隐私政策 | 百度百科合作平台 | 京ICP证030173号 京公网安备110000020000

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【数据科学】斯皮尔曼的等级相关系数（Spearman's coefficient）_斯皮尔曼等级相关系数-CSDN博客

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【数据科学】斯皮尔曼的等级相关系数（Spearman's coefficient）_斯皮尔曼等级相关系数-CSDN博客

【数据科学】斯皮尔曼的等级相关系数（Spearman's coefficient）

最新推荐文章于 2024-01-21 08:00:00 发布

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Big Data Analysis

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斯皮尔曼相关系数

Spearman's coefficient

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在统计数据中，斯皮尔曼的等级相关系数或斯皮尔曼的rho，以查尔斯斯皮尔曼命名并经常用希腊字母表示或，是秩相关的非参数度量（两个变量的排名之间的统计依赖性）。它评估了使用单调函数描述两个变量之间关系的程度。

两个变量之间的Spearman相关性等于这两个变量的秩值之间的Pearson相关性 ; 当Pearson的相关性评估线性关系时，Spearman的相关性评估单调关系（无论是线性的还是非线性关系）。如果没有重复的数据值，当每个变量是另一个的完美单调函数时，发生+1或-1的完美斯皮尔曼相关。

直观地，当两个变量之间的观察具有相似（或相关的1）等级（即变量内的观察的相对位置标签：第一，第二，第三等）时，两个变量之间的Spearman相关性将是高的。当观察结果与两个变量之间具有不相似（或完全相反的相关性）时，变量和低值。

Spearman系数适用于连续和离散序数变量。Spearman's 和肯德尔的可以表述为更一般的相关系数的特殊情况。

 

定义和计算

Spearman相关系数定义为排序变量之间的Pearson相关系数。

对于大小的样品n，所述n 原始分数， 转换为排名，，和计算自：

表示通常的Pearson相关系数，但应用于秩变量。是秩变量的协方差。 和是秩变量的标准偏差。

 

只有当所有n个等级都是不同的整数时，才能使用流行的公式计算

，是每个观察的两个等级之间的差异。n是观察的数量

 

相同的值通常是，每个分配的小数等级等于它们在值的升序中的位置的平均值，这相当于对所有可能的排列进行平均。

如果数据集中存在联系，则上面的简化公式会产生不正确的结果：只有在两个变量中，所有等级都是不同的，那么 （根据有偏差的方差计算）。即使当秩被归一化为[0; 1]（“相对等级”）时，甚至可以使用通过标准偏差归一化的第一个等式 - 因为它对平移和线性缩放都不敏感。

这个在数据集被截断的情况下也不应使用]方法; 也就是说，当前X个记录（无论是通过改变前等级还是改变后等级，或两者）都需要Spearman相关系数时，用户应使用上面给出的Pearson相关系数公式。

系数（σ）的标准误差由Pearson于1907年和Gosset于1920年确定

 

相关数量

还有一些其他数值测量可以量化观察对之间统计依赖的程度。其中最常见的是Pearson积矩相关系数，它是与Spearman等级相似的相关方法，用于衡量原始数字之间而不是等级之间的“线性”关系。

Spearman 等级相关的另一个名称是“等级相关”;观察的“等级”被“等级”取代。在连续分布中，按照惯例，观察等级总是比等级小一半，因此在这种情况下等级和等级相关性是相同的。更一般地，观察的“等级”与小于给定值的总体分数的估计成比例，半观察调整在观察值处。因此，这对应于绑定等级的一种可能的处理。虽然不寻常，但“等级相关”一词仍在使用中。

 

解释

Spearman相关的符号表示X（自变量）和Y（因变量）之间的关联方向。如果 X在X增加时趋于增加，则Spearman相关系数为正。如果X在X增加时趋于减小，则Spearman相关系数为负。Spearman相关系数为零表示当X增加时Y没有增加或减少的趋势。随着X和Y变得更接近彼此的完美单调函数，Spearman相关性的幅度增加。什么时候X和Y完全单调相关，Spearman相关系数变为1.完美的单调增加关系意味着对于任何两对数据值X i，Y i和X j，Y j，X i - X j和Y i - Y j总是有相同的符号。完美的单调递减关系意味着这些差异总是具有相反的符号。

Spearman相关系数通常被描述为“非参数”。这可以有两个含义。首先，当X和Y通过任何单调函数相关时，产生完美的Spearman相关性。将此与Pearson相关性进行对比，Pearson相关性仅在X和Y通过线性函数相关时给出完美值。其他感测，其中所述Spearman相关是，在不需要知识来获得其准确的采样分布（非参数即，知道参数）的接头的概率分布的X和Y。

 

示例

在此示例中，下表中的原始数据用于计算人的智商与每周在电视机前花费的小时数之间的相关性。

首先，评估。为此，请使用以下步骤，如下表所示。

按第一列排序数据（）。创建一个新列{\ displaystyle x_ {i}}并为其分配排名值1,2,3，... n。接下来，按第二列对数据进行排序（）。创建第四列并且类似地为其分配排名值1,2,3，... n。创建第五列 保持两个等级列之间的差异( 和）。创建一个最终列 保持列的值 平方。

同  发现，添加它们来查找。的值Ñ是10这些值现在可以被取代的回方程： 给

其评估为ρ = -29 / 165 = -0.175757575 ... ，P值 = 0.627188（使用t分布）。

这个低值表明智商和看电视的时间之间的相关性非常低，尽管负值表明看电视的时间越长智商越低。如果是原始值的关系，则不应使用此公式; 相反，应该在等级上计算Pearson相关系数（其中关系被赋予等级，如上所述）。

提供的数据图表。可以看出，可能存在负相关，但这种关系似乎不是确定的。

 

 

基于Spearman的rho的对应分析

经典对应分析是一种统计方法，可以对两个名义变量的每个值进行分数。通过这种方式，它们之间的Pearson 相关系数最大化。

这种方法有一种称为等级对应分析的方法，可以最大化Spearman的rho或Kendall的tau。

 

图示

当比较的两个变量是单调相关的，即使它们的关系不是线性的，Spearman相关性为1。这意味着x值大于给定数据点的所有数据点也将具有更大的y值。相比之下，这并没有给出完美的Pearson相关性。

 

当数据大致呈椭圆分布且没有明显的异常值时，Spearman相关和Pearson相关给出相似的值。

 

Spearman相关性不如Pearson相关性对两个样本尾部的强异常值敏感。那是因为斯皮尔曼的rho将异常值限制在其等级值。

 

正斯皮尔曼相关系数对应于X和Y之间增加的单调趋势。

 

负Spearman相关系数对应于X和Y之间的单调趋势减小。

 

参考文献：https://en.wikipedia.org/wiki/Spearman%27s_rank_correlation_coefficient

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【数据科学】斯皮尔曼的等级相关系数（Spearman's coefficient）

在统计数据中，斯皮尔曼的等级相关系数或斯皮尔曼的rho，以查尔斯斯皮尔曼命名并经常用希腊字母表示或，是秩相关的非参数度量（两个变量的排名之间的统计依赖性）。它评估了使用单调函数描述两个变量之间关系的程度。两个变量之间的Spearman相关性等于这两个变量的秩值之间的Pearson相关性 ; 当Pearson的相关性评估线性关系时，Spearman的相关性评估单调关系（无论是线性的还是非线性关系...

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文章目录引述斯皮尔曼相关系数（spearman）定义

引述

经过之前几节的学习，我们了解并掌握了皮尔逊相关系数。在学习中我们发现，皮尔逊相关系数的使用条件相当苛刻：两组变量必须是连续数据、呈现正态分布，且两者间必须成线性关系。如果我们在数学建模中拿到一组数据无法满足以上条件，那么有没有其他的方法去判断两组变量之间的相关性呢？答案是肯定的，它就是斯皮尔曼相关系数（spearman）.

斯皮尔曼相关系...

Spearman Rank（斯皮尔曼等级）相关系数

weixin_30437481的博客

01-24

2172

转自：http://blog.csdn.net/wsywl/article/details/5859751

1、简介

在统计学中，斯皮尔曼等级相关系数以Charles Spearman命名，并经常用希腊字母ρ（rho）表示其值。斯皮尔曼等级相关系数用来估计两个变量X、Y之间的相关性，其中变量间的相关性可以使用单调函数来描述。如果两个变量取值的两个集合中均不存在相同的两个元...

斯皮尔曼相关(Spearman correlation)系数概述及其计算例

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斯皮尔曼spearman相关系数

sup1feng的博客

02-01

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数学建模中斯皮尔曼相关系数的用法和代码

相关系数(皮尔逊pearson相关系数和斯皮尔曼spearman等级相关系数)

m0_62504956的博客

12-29

8312

（2）在不确定两个变量是什么关系的情况下，即使算出皮尔逊相关系数，发现很大，也不能说明那两个变量线性相关，甚至不能说他们相关，（1）如果两个变量本身就是线性的关系（前提），那么皮尔逊相关系数绝对值大的就是相关性强，小的就是相关性弱；对相关系数的解释是依赖于具体的应用背景和目的的。（2）离群点对相关系数的影响很大，例如图3，去掉离群点后，相关系数为0.98。1.连续数据，正态分布，线性关系，用pearson相关系数是最恰当，当然用。R返回的是相关系数表，P返回的是对应于每个相关系数的p值。

相关系数｜皮尔逊和斯皮尔曼

zedkyx的博客

06-21

6147

相关系数｜皮尔逊和斯皮尔曼

斯皮尔曼的等级相关系数

09-03

以几个单目标优化函数为例子，利用斯皮尔曼的等级相关系数计算两个单目标优化函数之间的相关性。

correlationanlysis1_spearman_斯皮尔曼系数matlab_

10-03

斯皮尔曼相关系数计算，运用MATLAB平台进行运行！

斯皮尔曼相关系数.zip_斯皮尔曼matlab_斯皮尔曼系数d_皮尔逊_皮尔逊系数_相关系数计算

07-15

斯皮尔曼相关性，斯皮尔曼系数一般有两个公式，由排行差分集合d计算而得（公式一）由排行集合x、y计算而得（斯皮尔曼等级相关系数同时也被认为是经过排行的两个随机变量的皮尔逊相关系数，以下实际是计算x、y的...

matlab计算皮尔逊相关系数、斯皮尔曼相关系数、正态分布检验

06-11

matlab计算皮尔逊相关系数、斯皮尔曼相关系数、正态分布检验

【数据科学】肯德尔等级相关系数（ Kendall's tau coefficient ）

探索世界，改变世界

10-12

5万+

在统计学中，Kendall等级相关系数，通常称为Kendall的tau系数（在希腊字母τ之后），是用于测量两个测量量之间的序数关联的统计量。甲tau蛋白测试是一种非参数假设检验用于基于所述tau蛋白系数统计依赖性。

它是衡量等级相关：数据的排序的相似度时排名由每个量。它以1938年开发的莫里斯·肯德尔命名，尽管古斯塔夫·费希纳在1897年的时间序列背景下提出了类似的措施。

直观地说，两个变量之...

【数据可视化】Pandas画散点图

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08-13

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pandas.DataFrame.plot.scatter

 

使用函数：DataFrame.plot.scatter(x, y, s=None, c=None, **kwds)

功能：创建具有不同标记点大小和颜色的散点图。

 

每个点的坐标由两个数据帧列定义，实心圆用于表示每个点。这种图可用于查看两个变量之间的复杂相关性。点可以是例如自然2D坐标，例如地图中的经度和纬度，或者通常可以是...

【Pandas】修改Pandas的行或列的名字（重命名）

探索世界，改变世界

08-10

4万+

pandas.DataFrame.rename

使用函数： DataFrame.rename(mapper=None, index=None, columns=None, axis=None, copy=True, inplace=False, level=None)

功能：更改轴标签

函数字典值必须是唯一的（1对1）。未包含在 字典/Series  中的标签将保留原样。列出的额外标签不会引...

斯皮尔曼等级相关系数

08-07

斯皮尔曼等级相关系数（Spearman's rank correlation coefficient）是一种用于衡量两个变量之间的相关性的统计方法。它基于两个变量的等级或顺序而不是具体的数值大小。

斯皮尔曼等级相关系数的取值范围在-1到1之间，其中-1表示完全的反相关，0表示无相关性，而1表示完全的正相关。它的计算方法包括以下步骤：

1. 对于每个变量，将其观测值按照大小进行排序，从小到大分配等级。

2. 计算每对观测值的等级差。

3. 对于每一对等级差，计算其乘积。

4. 将所有乘积求和。

5. 使用以下公式计算斯皮尔曼等级相关系数：

ρ = 1 - (6 * Σd^2) / (n^3 - n)

其中，ρ表示斯皮尔曼等级相关系数，Σd^2表示所有等级差的平方和，n表示样本的数量。

斯皮尔曼等级相关系数适用于非线性关系的变量，并且对于数据中的异常值具有较好的鲁棒性。它常用于社会科学、心理学和生物学等领域中的数据分析。

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/roʊ/ (symbol P, ρ)

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希腊语字母表的第17个字母

(rho在剑桥英语-中文（简体）词典的翻译 © Cambridge University Press)

rho的例句

rho

The explanatory power of the model (adjusted rho square) is satisfactory at 24 per cent.

来自 Cambridge English Corpus

Thus, the rho-like protein appears to play a key role in contractile ring formation and stability.

来自 Cambridge English Corpus

These data suggest that a rho protein may function in the organisation and maintenance of the actin filament cytoskeleton.

来自 Cambridge English Corpus

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顺序类别的 Spearman 的 rho 和 Pearson 的 r 是什么？ - Minitab

顺序类别的 Spearman 的 rho 和 Pearson 的 r 是什么？ - Minitab

menuMinitab® 20支持顺序类别的 Spearman 的 rho 和 Pearson 的 r 是什么？了解关于 Minitab Statistical Software 的更多信息

要获取这些统计量，请选择统计 > 表格 > 交叉分组表和卡方，单击其他统计量，然后选择顺序类别的相关系数。

使用 Spearman 的 rho 和 Pearson 的 r 来评估两个具有顺序类别的变量的关联。顺序类别是自然顺序，如小、中和大。

系数值介于 -1 到 +1 之间。系数的绝对值越大，变量之间的关系越强。绝对值为 1 时表示完全相关，值为 0 时则表示不存在顺序关系。将中间值解释为弱相关、中度相关还是强相关取决于您的目标和要求。

Spearman 的 rho 和 Pearson 的 r 的示例

例如，分析客户对汽车商品特许经销商的满意度，它为新车提供三种级别的连续服务：无服务、标准服务和高级服务。抽取随机数量的客户样本，询问他们对客户服务不满意、中立还是满意。您的数据包括两个顺序变量：服务包和客户满意度。您要确定客户所享受服务的级别与其总体满意度之间是否存在关联。在下面的双向表中输入数据：

 

无服务

标准服务

高级服务

不满意

162

104

36

中立

99

91

93

满意

39

105

171

在此表格中，Spearman 的 rho 和 Pearson 的 r 均为 0.424。您可以断定服务级别与客户满意度之间存在正关联：选择较高服务计划的客户倾向于对此业务表示出更高的满意度。

Spearman 的 rho 和 Pearson 的 r 的重要注意事项

记住，相关性不隐含因果关系。例如，如果冰淇淋销售与游泳者受到鲨鱼攻击正相关，并不意味着冰淇淋消费在某种程度上导致了鲨鱼攻击。另一个变量，例如炎热的天气，可能是导致冰淇淋销售和下海游泳人数增加的原因。

通过交叉分组表和卡方计算的 Pearson 统计量仅适用于顺序数据。例如，将连续值 22、37 和 53 分析为顺序值 1、2 和 3。要计算两列或更多列连续数据的 Pearson 相关系数，请改用统计 > 基本统计 > 相关。

注意对于文本值而言，您应在必要时更改默认值的顺序，以显示类别的自然顺序。例如，除非更改含有文本值“窄”、“中等”和“宽”的列的值顺序，否则这些值将按照字母顺序排列，并分析为顺序值 2、1 和 3。Minitab.com许可证门户商店博客联系我们Cookie 设置Copyright © 2023 Minitab, LLC. All rights Reserved.EnglishfrançaisDeutschportuguêsespañol日本語한국어中文（简体）

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RHO及相关致病机理是什么?RHO基因治疗研究进展如何?

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RHO及相关致病机理是什么?RHO基因治疗研究进展如何?

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RHO及相关致病机理是什么?RHO基因治疗研究进展如何?

今天（6月6日）是第28个全国爱眼日，旨在营造全社会爱眼护眼的良好氛围。那么你是否知道，今年的爱眼日主题是什么呢？

 

为关注罕见病研究，赛业生物全新策划罕见病“十宗罪”专栏，旨在从罕见病的致病机理、临床前疾病模型、基因治疗方法等多个角度出发，深入研究罕见病发生和发展的原因。通过探索这些罕见病的原罪，我们希望能够开发更为完善的疾病模型，同时促进罕见病相关药物的研发。本期全国爱眼日特辑，让我们一起来关注眼科罕见病——由RHO基因突变引起的视网膜色素变性。

 

RHO及相关致病机理

RHO的研究始于上世纪50年代。1957年，美国生物化学家George Wald发现了视觉反应所需的光敏色素，即视紫红质（Rhodopsin, RHO）[1]，Wald的发现为后来可能实现的视觉复原技术提供了重要基础。RHO突变是主要的导致视网膜色素变性的罪魁祸首，大多数RHO突变会导致紫红蛋白在感光细胞中高水平表达，使得大量的突变蛋白在细胞中定位异常并聚集，造成感光细胞凋亡，不能行使正常的光信号传导功能，其中P23H是RHO突变占比最多的一种致病突变。

 

早在2000年就有研究人员将野生型RHO基因转入P23H转基因大鼠（该大鼠患有视网膜色素变性）中，发现递送疗法显著减缓了P23H转基因大鼠的光感受器退化速度[2]，但是，仅仅补充RHO的表达就可以治疗由RHO基因突变导致的视网膜色素变性（Retinitis Pigmentosa , RP）吗？答案显然不是的，因为针对像RHO-adRP这样的显性疾病，还必须同时摆脱对细胞有害的基因产物。

 

RHO基因治疗研究进展

我们来看看在RHO相关的基因治疗中，如何通过1+1=1的方式治疗RP（即两种方式作用于同一种疾病）。

AAV递送

Roche和Spark合作开发的药物RhoNova通过AAV2/5递送shRNA抑制内源性RHO突变基因表达+补充野生型RHO基因表达=治疗RHO突变导致的RP（shRNA+WT-RHO=RP），临床前研究使用P23H转基因小鼠作为药效研究模型[3]。

 

但更早期的临床前实验表明，shRNA的抑制效果在犬疾病模型和人细胞中是有效的，但是在小鼠的Rho序列中是不保守的[4]。这表明P23H转基因大小鼠模型对于筛选高效的、与患者体内疗效一致的shRNA是有缺陷的，因为其内源性Rho基因与人RHO基因的不完全一致性，并不是理想的研究RP相关基因治疗的临床前疾病模型。

 

靶向RHO的CRISPR疗法

张锋创立的Editas公布了其体内基因编辑疗法EDIT-103用于治疗由RHO突变导致的RP的相关成果。EDIT-103是一种不依赖于突变的基于CRISPR/Cas的基因编辑疗法，递送敲除和补充突变RHO基因的双AAV5载体，以保持感光器功能。该疗法有望解决150多种RHO突变导致的RP，同样也是通过gRNA和Cas靶向突变RHO来抑制其表达+补充野生型RHO基因表达=治疗RHO突变导致的RP（Cas+WT-RHO=RP）。

 

值得注意的是，为了筛选高效且特异的gRNA，在临床前动物模型中，研究人员非常聪明地使用了人源化RHO小鼠模型（mRhohRHO/+），即人RHO基因原位替换鼠源Rho基因。临床前研究表明，hRHO在小鼠体内正常表达，且EDIT-103在该人源化RHO小鼠中表现出显著的敲除和递送效果[5]。不难发现，在RP相关的基因疗法中，疾病模型携带人源基因对于筛选高效特异的药物是必要条件，人源化疾病模型小鼠是RP相关药物研发中更好的疾病模型。

 

应运而生的全基因组人源化模型HUGO-GTTM

Editas公布的管线中除了RHO突变导致的RP，还有CEP290突变导致的先天性黑曚症10型、USH2A突变导致的Usher综合征、SERPINA1突变导致的α-1抗胰蛋白酶缺乏症、CFTR突变导致的囊性纤维化等疾病管线，这些管线的临床前疾病模型都使用到了人源化小鼠。

 

为加速新药研发，「下一代全基因组人源化模型构建计划」HUGO-GTTM Program应运而生（HUGO-GT: Humanized Genomic Ortholog for Gene Therapy）。即在罕见病数据中心RDDC（一站式获取疾病-基因-动物模型-药物临床信息的生物数据平台）的基础上，赛业生物通过TurboKnockout技术与BAC融合技术实现基因组大片段替换，构建了更适用于遗传性疾病研究和基因治疗药物开发的全基因组人源化模型。

 

 

在眼科疾病领域，赛业生物自主研发的全基因组人源化小鼠包括野生型全基因组人源化小鼠hRHO以及在此基础上构建的P23H点突变疾病模型hRHO-P23H，以及hCEP290等其他眼科模型。

 

相关疾病

打靶基因

打靶类型

视网膜色素变性

Rho

KO、CKO、Humanization(WT、MU)

Mertk

KO、CKO

Rpgr

KO、CKO

Crb1

KO、CKO

Rd1(Pde6b)

MU、KO

Rd10(Pde6b)

MU

Rp2

KO、CKO

黄斑变性

Vegfa

Humanization(KI、TG)

Abca4(Abcr)

KO、CKO、Humanization

慢性视网膜变性

Prph2

KO、CKO

先天性黑蒙症2型

Rpe65

KO、MU

先天性黑蒙症4型

Aipl1

KO、CKO

先天性黑蒙症10型

Cep290

KO、CKO、Humanization(WT、MU)

先天性黑蒙症13型

Rdh12

KO、CKO

全色盲

Cnga3

KO、CKO

角膜内皮营养不良

Tcf4

KO、CKO、Humanization

先天性无虹膜症

Pax6

KO、CKO

无脉络膜症

Chm

KO、CKO

Usher综合征

Ush2A

Humanization(WT、MU)

Myo7A

CKO

卵黄样黄斑变性

Best1

KO、CKO

遗传性视网膜劈裂症

Rs1

KO、CKO

眼皮肤白化病1型

Tyr

CKO

眼皮肤白化病3型

Tyrp1

KO、CKO

眼白化病

Gpr143

KO、CKO

Bietti结晶样角膜视网膜营养不良

Cyp4v3

KO、CKO

角膜营养不良

Tgfbi

KO、CKO、MU、Humanization

Wolfram综合征

Wfs1

KO、CKO

弹力纤维假黄瘤

Abcc6

KO、CKO

视网膜色素变性、先天性黑蒙症

Tub

KO、CKO

蓝锥细胞增强症

Nr2e3

KO、CKO

 

参考文献

Wald G . THE MOLECULAR BASIS OF VISUAL EXCITATION[J]. American Scientist, 1954, 42(1):73-95.

Lavail M M ,  Yasumura D ,  Matthes M T , et al. Ribozyme rescue of photoreceptor cells in P23H transgenic rats: Long-term survival and late-stage therapy[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2000, 97(21):11488-11493.

Meng D ,  Ragi S D ,  Tsang S H . Therapy in Rhodopsin-Mediated Autosomal Dominant Retinitis Pigmentosa[J]. Molecular Therapy, 2020, 28(10).

Mutation-independent rhodopsin gene therapy by knockdown and replacement with a single AAV vector[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115(36):E8547-E8556.

https://ir.editasmedicine.com/news-releases/news-release-details/editas-medicine-presents-preclinical-data-edit-103-rhodopsin-0

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Rho激酶在免疫细胞及自身免疫性疾病中的研究进展 - 国际免疫学杂志

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Rho激酶在免疫细胞及自身免疫性疾病中的研究进展

王新洁

何焱玲

国际免疫学杂志, 2020,43(1)

: 83-87. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4394.2020.01.016

摘要Rho激酶(Rho-associated kinases，ROCKs)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，是Rho GTP酶下游重要的效应分子。Rho GTPase酶能够在与GTP结合的活性状态和与GDP结合的失活状态之间转换，发挥分子开关的作用。Rho GTPase/ROCK信号通路是体内普遍存在的一条通路，在细胞骨架建成，细胞的增殖、收缩、粘附、迁移等生物学行为中发挥重要的调控作用。近年来大量研究表明，ROCKs通过影响T淋巴细胞、B淋巴细胞、以及单核细胞、巨噬细胞等免疫细胞的活化、增殖、粘附、迁移等方面，进而参与多种自身免疫性疾病，如系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus，SLE)，类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis，RA)，系统性硬化症(systemic sclerosis，SSc)等的发病过程。因此，在未来ROCKs有望为多种自身免疫性疾病提供一种新的治疗靶点。

引用本文:

王新洁,

何焱玲.

Rho激酶在免疫细胞及自身免疫性疾病中的研究进展

[J]

. 国际免疫学杂志,2020,43

(1): 83-87.

DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4394.2020.01.016

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Rho GTP酶(Rho GTPase)属于Ras蛋白超家族当中的一员，包括20多种细胞内信号蛋白，如RhoA，Rac，Cdc42等，是一种普遍存在于真核生物当中的小分子GTP结合蛋白，在胞质的骨架建成方面发挥了重要作用。Rho蛋白家族可以通过脂质化修饰作用锚定于细胞膜，在Rho-GRFs，Rho-GAPs和Rho-GDIs的调控作用下，能够在与GTP结合的活性状态和与GDP结合的失活状态之间转换，从而实现分子开关的作用。Rho激酶(Rho-associated kinases，ROCKs)是Rho GTP酶下游重要的效应分子，是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，在细胞骨架的形成，细胞的运动，迁移以及基因的表达等诸多方面发挥重要的调控作用[1,2,3,4]。目前有研究证实，ROCKs参与了很多信号通路的激活过程，所以在很多病理状态中，ROCKs都发挥了重要作用，如冠状动脉粥样硬化、肺动脉高压、肺间质纤维化以及急性肾损伤等[5,6]。但目前对于ROCKs在自身免疫性疾病中的研究相对较少，现对ROCKs对免疫细胞的调控作用及其在自身免疫性疾病中的研究进展做一综述。

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贡献者信息

王新洁

首都医科大学附属北京朝阳医院皮肤科，北京　100020

何焱玲

首都医科大学附属北京朝阳医院皮肤科，北京　100020

通信作者

何焱玲

首都医科大学附属北京朝阳医院皮肤科，北京　100020

Email：heyldoc@163.com

关键词

Rho激酶;

免疫细胞;

自身免疫性疾病;

基金项目

北京市科委

（Z151100003915129）

利益冲突

利益冲突　所有作者均声明不存在利益冲突

历史

出版日期：2020-01-05

收稿日期：2019-05-06

Review

Research progress of Rho kinases in immune cells and autoimmune diseases

Wang Xinjie,  He Yanling

Published 2020-01-05

Cite as Int J Immunol, 2020,43(1): 83-87. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4394.2020.01.016

Abstract

The Rho-associated kinases(ROCKs) are serine/threonine protein kinases and important downstream effectors of Rho GTP enzyme.Rho GTPases act as molecular switches between an inactive and the inactive state of GDP binding, playing the role of molecular switch.Rho GTPase/ROCK signaling pathway is a common pathway, which plays an important role in the formation of cytoskeleton, cell proliferation, contraction, adhesion, migration and other biological behaviors.In recent years, a large number of studies have shown that ROCKs participate in a variety of autoimmune diseases, such as systemic lupus erythematosus(SLE), rheumatoid arthritis(RA)and systemic sclerosis(SSc), by affecting the activation, proliferation, adhesion and migration of T lymphocytes, B lymphocytes, monocytes, macrophages and other immune cells.Therefore ROCKs may be a new therapeutic target for autoimmune disease in the future.

Key words:

Rho kinases; Immune cells; Autoimmune disease

Contributor Information

Wang Xinjie

Department of Dermatology, Beijing Chaoyang Hospital, Capital Medical University, Beijing 100020, China

He Yanling

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信号通路

调控作用

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